O nouă armă pentru diagnosticul de tuberculoză și detectarea rezistenței la medicamente: o secvențiere țintită de nouă generație (TNGS) combinată cu învățarea automată pentru diagnosticul de hipersensibilitate la tuberculoză
Raport de literatură: CCA: un model de diagnostic bazat pe TNG -uri și învățare automată, care este potrivit pentru persoanele cu tuberculoză mai puțin bacteriană și meningită tuberculoasă.
Titlul tezei: Secvențiere de generație următoare și învățare automată a tuberculoasă și învățare automată: o strategie de diagnostic ultra-sensibilă pentru tubare pulmonare pazifice și meningită tubulară.
Periodic: 《Clinica Chimica Acta》
Dacă ： 6.5
Data publicării: ianuarie 2024
În combinație cu Universitatea de la Universitatea din China de Științe și Spitalul Chest din Beijing din Capital Medical University, Macro & Micro-Test a înființat un model de diagnostic tuberculoză bazat pe noua generație de tehnologie de secvențiere țintită (TNGS) și metodă de învățare automată, care a furnizat ultra-înalt Sensibilitatea detectării pentru tuberculoză cu puține bacterii și meningită tuberculoasă, a oferit o nouă metodă de diagnostic de hipersensibilitate pentru diagnosticul clinic al Două tipuri de tuberculoză și au ajutat diagnosticul precis, detectarea rezistenței la medicamente și tratamentul tuberculozei. În același timp, se constată că CFDNA plasmatică a pacientului poate fi utilizat ca un tip de eșantion adecvat pentru eșantionarea clinică în diagnosticul de TBM.
In this study, 227 plasma samples and cerebrospinal fluid samples were used to establish two clinical cohorts, in which the laboratory diagnostic cohort samples were used to establish the machine learning model of tuberculosis diagnosis, and the clinical diagnostic cohort samples were used to verify the established Model de diagnostic. Toate eșantioanele au fost vizate pentru prima dată de un grup de sondă de captare special conceput pentru Mycobacterium tuberculosis. Apoi, pe baza datelor de secvențiere TB-TNGS, modelul arborelui de decizie este utilizat pentru a efectua validarea încrucișată de 5 ori pe seturile de instruire și validare ale cozii de diagnostic de laborator și se obțin pragurile de diagnostic ale probelor plasmatice și probele de lichid cerebrospinal. Pragul obținut este adus în două seturi de teste de coadă de diagnostic clinic pentru detectare, iar performanța de diagnostic a elevului este evaluată prin curba ROC. În cele din urmă, s -a obținut modelul de diagnostic al tuberculozei.
Fig. 1 Diagrama schematică a proiectării cercetării
Rezultate: Conform pragurilor specifice ale eșantionului de ADN CSF (ASC = 0,974) și eșantionul CFDNA plasmatică (ASC = 0,908) determinat în acest studiu, printre 227 de probe, sensibilitatea eșantionului de CSF a fost de 97,01%, specificitatea a fost de 95,65%și Sensibilitatea și specificitatea probei plasmatice au fost de 82,61% și 86,36%. În analiza a 44 de probe pereche de CFDNA plasmatică și ADN -ul lichidului cefalorahidian de la pacienții cu TBM, strategia de diagnostic a acestui studiu are o consistență ridicată de 90,91% (40/44) în ADN -ul plasmatic și ADN -ul lichidului cerebrospinal, iar sensibilitatea este de 95,45% (42/44). La copiii cu tuberculoză pulmonară, strategia de diagnostic a acestui studiu este mai sensibilă la eșantioanele plasmatice decât rezultatele de detectare XPERT a probelor de suc gastric de la aceiași pacienți (28,57% față de 15,38%).
Fig. 2 Analiza performanței Tuberculozei Model de diagnostic pentru eșantioane de populație
