Recent,CDC săptămânal Chinaa publicat un articol de cercetare important care descrie investigația epidemiologică și etiologică a unui focar de gastroenterită acută cauzat de rotavirusul de grup C (RVC) la o școală primară din Luzhou, provincia Sichuan, în octombrie 2025. În special, kitul de captare a agenților patogeni țintiți (probe-capture) de mare randament de la Macro & Micro-Test și tehnologia de secvențiere a îmbogățirii întregului genom au jucat un rol esențial în investigație. Permițând identificarea precisă a agenților patogeni și caracterizarea genomică completă, tehnologia a furnizat dovezi științifice esențiale pentru confirmarea rapidă a focarului, urmărirea precisă a sursei și controlul eficient al focarului.
Focar brusc: Primul focar de RVC raportat în sud-vestul Chinei
Pe 15 octombrie 2025, un focar de gastroenterită acută a apărut la o școală primară din Luzhou. Școala avea o populație totală de 1.943 de elevi și membri ai personalului, cu 32 de cazuri raportate, inclusiv 6 confirmate de laborator și 26 de cazuri diagnosticate clinic, rezultând o rată generală de atac de 1,65%. Focarul a atins vârful între 15 și 16 octombrie, clasa a VII-a, gradul a V-a, înregistrând cea mai mare rată de atac (23,08%). Majoritatea pacienților erau copii de vârstă școlară (vârsta mediană: 10 ani), prezentând în principal vărsături (65,62%), diaree (46,87%) și dureri abdominale (37,50%). Simptomele au durat de obicei 1-3 zile, iar toți pacienții s-au recuperat fără complicații severe.
Ancheta epidemiologică a identificat cazul index ca fiind un băiat în vârstă de 11 ani din clasa a VII-a, clasa a V-a. Sora sa mai mică dezvoltase simptome similare înaintea lui, sugerând transmiterea în gospodărie ca sursă inițială. Gestionarea inadecvată a vărsăturilor în campus - inclusiv măturatul și eliminarea directă fără dezinfecție la timp sau izolarea zonei - combinată cu o igienă precară a mâinilor în rândul elevilor, a facilitat probabil transmiterea ulterioară. Majoritatea sălilor de clasă afectate erau situate între etajele al doilea și al cincilea și aveau toalete comune pentru bărbați, ceea ce indică faptul că atât transmiterea prin aerosoli, cât și cea prin contact ar fi putut contribui la răspândire.
Ancheta a devenit deosebit de dificilă deoarece screening-ul de rutină al agenților patogeni, inclusiv testele pentru norovirus și rotavirus de grup A, a dat rezultate negative, indicând faptul că responsabil era un agent patogen mai puțin frecvent.
Diagnostic etiologic: Secvențierea întregului genom realizată de Macro & Micro-Test identifică vinovatul
Testele inițiale pentru norovirus au fost negative. Ulterior, CDC-ul din Luzhou a utilizat un test PCR multiplex în timp real pentru agenți patogeni gastrointestinali, capabil să detecteze simultan 28 de agenți patogeni, inclusiv 8 virusuri, 17 bacterii și 3 paraziți, pentru a examina opt probe clinice. Pe 17 octombrie, șase probe au fost testate pozitiv pentru rotavirusul de grup C, identificând cu succes agentul patogen cauzal.
Pentru a urmări mai departe sursa focarului, cercetătorii au efectuat atât secvențiere metagenomică cu nanopori, cât și secvențiere de îmbogățire a întregului genom cu captură de sondă de la Macro & Micro-Test pe cinci probe pozitive. Această abordare a generat cu succes cinci secvențe complete ale genomului RVC (SC01–SC05). Strategia integrată de screening PCR multiplex rapid, urmată de secvențiere a întregului genom de înaltă rezoluție, a oferit un suport tehnic robust pentru epidemiologia moleculară precisă și urmărirea sursei.
Perspective științifice: Prima identificare a genotipului M2 în sud-vestul Chinei
Pe baza datelor de înaltă calitate ale întregului genom generate folosind tehnologia Macro & Micro-Test, echipa de cercetare a raportat câteva descoperiri științifice importante:
Confirmarea unui focar monoclonal:Toate cele cinci izolate virale au avut în comun un genotip identic la nivelul întregului genom (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2), cu doar 0-1 diferențe în polimorfismul unui singur nucleotid (SNP), demonstrând în mod concludent că focarul a provenit dintr-un singur lanț de transmitere.
Descoperirea genotipului M2:Analiza filogenetică a relevat că tulpinile RVC Luzhou aparțineau genotipului M2, mai degrabă decât genotipului M3, considerat anterior predominant printre tulpinile RVC chinezești. Această constatare pune sub semnul întrebării înțelegerea convențională a distribuției genotipurilor RVC în China și confirmă apariția genotipului M2 în sud-vestul Chinei.
Dovezi ale legăturilor de transmisie internaționale:Compararea întregului genom a demonstrat o similaritate genetică ridicată între tulpinile Luzhou și tulpinile RVC raportate anterior în Yunnan (2025), Novosibirsk, Rusia (2017) și Italia (2012), sugerând existența unei rețele de transmitere eurasiatice active.
Implicații pentru prevenire și control: Depistarea timpurie și intervenția rapidă sunt esențiale
După identificarea agenților patogeni, CDC-ul Luzhou a implementat imediat măsuri complete de control, inclusiv izolarea cazurilor, dezinfecția mediului, gestionarea standardizată a vărsăturilor și suspendarea temporară a claselor. Focarul a fost controlat cu succes într-o singură perioadă de incubație, fără a fi raportate cazuri suplimentare după 21 octombrie.
Investigația oferă, de asemenea, o lecție importantă de sănătate publică: pentru focarele de gastroenterită grupate care au rezultate negative atât pentru rotavirusul de grup A, cât și pentru norovirus, rotavirusul de grup C și alte rotavirusuri care nu aparțin grupului A ar trebui incluse în screeningul diagnostic de rutină.
Acest studiu reprezintă primul focar de rotavirus de grup C raportat în sud-vestul Chinei și prima identificare a genotipului M2 în regiune, extinzând înțelegerea actuală a epidemiologiei RVC în Asia de Est. În această investigație, soluția integrată a Macro & Micro-Test, care combină screening-ul PCR multiplex cu secvențierea îmbogățirii întregului genom, a demonstrat o valoare practică semnificativă, permițând atât identificarea rapidă a agenților patogeni, cât și urmărirea sursei moleculare de înaltă rezoluție, oferind un cadru tehnic reproductibil pentru investigarea și controlul precis al viitoarelor focare de boli infecțioase.
Data publicării: 30 iulie 2026